Цель Каунасской теплофикационной электростанции - внедрением новых технологий, щадящих окружающую среду, меньшее загрязнение воздуха, грунта, водоемов, снижение шума. Еще один очень важный принцип слаженного развития – эффективное использование природных ресурсов.

В проекте новой электростанции увеличена высота новых дымовых труб на 20 метров (с 60 до 80 м), таким образом, в городе уменьшается концентрация приземных загрязнений, выбрасываемых в воздух.
В настоящее время на одной из дымовых труб заканчиваются работы по налаживанию системы мониторинга дыма. Эта система, оборудованная в дымовой трубе, фиксирует концентрацию загрязнений, выбрасываемых в окружающую среду. Таким образом, контролируется концентрация загрязнений, чтобы оно не превышало норм охраны окружающей среды.
После реализации Проекта развития Каунасской электростанции значительно уменьшится количество выбрасываемых загрязнений. После внедрения более эффективной технологии производства тепловой и электроэнергии при производстве одного и того же количества энергии будет меньше загрязнений.
Результаты распространения шума показали, что уровень шума планируемой электростанции в дневное время не будет превышать допускаемого уровня шума в зоне жилых домов и зданий общественного назначения уже на границе территории Каунасской электростанции. Территория электростанции не граничит с жилыми территориями или территориями административного назначения. На ближайшей жилой территории, находящейся на расстоянии около 250 м на северо-восток от планируемых установок, допустимый уровень шума не будет превышаться в дневное и ночное время.

После увеличения тепловой и электрической мощности Каунасской электростанции, потребуется больше промышленной воды для производственных нужд, потому будет увеличено количество воды, забираемой из Каунасского водохранилища. Для слива образующихся сточных вод остается прежняя система слива производственных сточных вод. Количество и порядок слива поверхностных (дождевых) сточных вод во время планируемой хозяйственной деятельности остаются без изменений. После выполненного исследования установлено, что производственные и поверхностные сточные воды, образующиеся и удаляемые в окружающую среду во время планируемой хозяйственной деятельности, не будут иметь негативного воздействия на качество воды реки Неман.